标签：
一、版本3
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描述 |
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version |
版本号，设为3 |
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Cols |
列数 |
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Rows |
行数 |
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TotalX |
和Cols一样 |
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TotalY |
和Rows一样 |
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OffsetX |
无用，设置为0 |
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OffsetY |
无用，设置为0 |
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GridCornerUL |
左上角的XY坐标 |
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GridCornerUR |
右上角的XY坐标 |
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GridCornerLR |
右下角的XY坐标 |
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GridCornerLL |
左下角的XY坐标 |
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Axis-InvertX |
无用，设置为0 |
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Axis-InvertY |
无用，设置为0 |
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swapXY |
无用，设置为0 |
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DatHeader |
DAT文件的头部，包含了cdf型号 |
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Algorithm |
用来生成CEL文件的算法 |
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AlgorithmParameters |
算法参数 |
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[INTENSITY] |
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NumberCells |
Cell的数目，等于Rows*Cols |
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CellHeader |
X Y MEAN STDV NPIXELS |
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NA |
这部分每一行是一个Cell的数据，包括Cell的X坐标、Y坐标、平均荧光强度值，方差、用了多少像素来计算这个平均值。共NumberCells行 |
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[MASKS] |
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NumberCells |
Masked Cell的数目 |
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CellHeader |
X Y |
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NA |
这部分每一行是一个Masked Cell的数据，包括Masked Cell的X坐标、Y坐标 |
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[OUTLIERS] |
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NumberCells |
Outlier Cell的数目 |
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CellHeader |
X Y |
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NA |
这部分每一行是一个Outlier Cell的数据，包括Outlier Cell的X坐标、Y坐标 |
二、版本4
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描述 |
数据类型 |
C语言读取方法 |
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Magic number |
幻数，设为64 |
int |
fread_int32 |
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Version number |
版本号，设为4 |
int |
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Number of columns |
列数 |
int |
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Number of rows |
行数 |
int |
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Number of cells |
Cell的数目，等于行数*列数 |
int |
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Header length |
头部的长度 |
int |
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Header |
头部 |
char，长度是Header length |
fread |
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Algorithm name length |
算法名的长度 |
int |
fread_int32 |
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Algorithm name |
算法名 |
char，长度是Algorithm name length |
fread_char |
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Algorithm parameters length |
算法参数长度 |
int |
fread_int32 |
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Algorithm parameters |
算法参数 |
char，长度是Algorithm parameters length |
fread_char |
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Cell margin |
计算Cell强度的余量 |
int |
fread_int32 |
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Number of outlier cells |
Outlier Cell的数目 |
DWORD |
fread_uint32
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Number of masked cells |
Masked Cell的数目 |
||
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Number of sub-grids |
子网格的数目 |
int |
fread_int32 |
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Cell entries 每个Cell的数据包括intensities、stddev、npixels，共Number of cells个Cell
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强度intensities |
float |
fread_float32 |
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方差stddev |
|||
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像素npixels |
short
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fread_int16 |
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Masked entries 每个Masked Cell的数据包括X坐标、Y坐标，共Number of masked cells个Masked Cell |
X |
||
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Y |
|||
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Outlier entries 每个Outlier Cell的数据包括X坐标、Y坐标，共Number of outlier cells个Outlier Cell |
X |
||
|
Y |
|||
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Sub-grid entries 每个Sub-grid的数据包括14项，共sub-grids个Sub-grid |
row number |
int |
fread_int32 |
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column number |
|||
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upper left x coordinate in pixels |
float |
fread_float32 |
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upper left y coordinate in pixels |
|||
|
upper right x coordinate in pixels |
|||
|
upper right x coordinate in pixels |
|||
|
lower left x coordinate in pixels |
|||
|
lower left y coordinate in pixels |
|||
|
lower right x coordinate in pixels |
|||
|
lower right x coordinate in pixels |
|||
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left cell position |
int |
fread_int32 |
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top cell position |
|||
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right cell position |
|||
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bottom cell position |
三、版本1
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描述 |
数据类型 |
C语言读取方法 |
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Magic number |
幻数，设为59 |
unsigned char |
fread_be_uchar |
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Version |
版本号，设为1 |
||
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n_data_groups |
数据的组数 |
int |
fread_be_int32 |
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data_type_id_len |
数据类型编号的长度 |
fread_be_int32 |
|
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data_type_id |
数据类型编号， |
char ，长度是data_type_id_len |
fread_be_char |
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unique_file_id_len |
文件编号长度 |
int |
fread_be_int32 |
|
unique_file_id |
文件编号 |
char ，长度是unique_file_id_len |
fread_be_char |
|
Date_time_len |
日期长度 |
int |
fread_be_int32 |
|
Date_time |
日期 |
char，长度是Date_time_len |
fread_be_uint16 |
|
locale_len |
|
int |
fread_be_int32 |
|
locale |
|
char，长度是locale_len |
fread_be_int32
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n_name_type_value |
name_type_value的长度 |
int |
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name_type_value，每个name_type_value的数据有6项，共n_name_type_value个name_type_value当name为affymetrix-array-type的时候，对应的value就是CDF型号了 |
name_len |
int |
fread_be_int32 |
|
name |
char，长度为name_len |
fread_be_uint16 |
|
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value_len |
int |
fread_be_int32 |
|
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value |
char，长度为value_len |
fread_be_char |
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type_len |
int |
fread_be_int32 |
|
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type |
char，长度为type_len |
fread_be_uint16 |
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n_parent_headers（决定了某个方法的递归次数） |
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int |
fread_be_int32 |
|
file_position_nextgroup |
|
unsigned int |
fread_be_uint32 |
|
file_position_first_data |
|
||
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n_data_sets |
|
int |
fread_be_int32 |
|
data_group_name_len |
|
int |
fread_be_int32 |
|
data_group_name |
|
char，长度为data_group_name_len |
fread_be_uint16 |
|
file_pos_first |
|
unsigned int |
fread_be_uint32 |
|
data_set_name_len |
|
int |
fread_be_int32 |
|
data_set_name |
|
char，长度为data_set_name_len |
fread_be_uint16 |
|
n_name_type_value |
|
int |
fread_be_int32 |
|
ncols |
探针数目 |
unsigned int |
fread_be_uint32 |
|
col_name_type_value_name_len |
|
int |
fread_be_int32 |
|
col_name_type_value_name |
|
char，长度为col_name_type_value_name_len |
fread_be_uint16 |
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col_name_type_value_type |
|
unsigned char |
fread_be_uchar |
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col_name_type_value_size |
|
int |
fread_be_int32 |
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data_set，存储探针强度的数据集，根据col_name_type_value_type的值确定data_set是哪种数据类型。data_set共包含ncols个数据 |
col_name_type_value_type为0 |
char |
fread_be_char |
|
col_name_type_value_type为1 |
unsigned char |
fread_be_uchar |
|
|
col_name_type_value_type为2 |
short |
fread_be_int16 |
|
|
col_name_type_value_type为3 |
unsigned short |
fread_be_uint16 |
|
|
col_name_type_value_type为4 |
int |
fread_be_int32 |
|
|
col_name_type_value_type为5 |
unsigned int |
fread_be_uint32 |
|
|
col_name_type_value_type为6 |
float |
fread_be_float32 |
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原文地址：http://www.cnblogs.com/xianwen/p/4522513.html
