ASE测试

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选择的品种组合为：父本（p1）9311，为籼稻。 母本(p2)12，为粳稻。 后代（f1）F12.

数据为RNA-seq数据。R 代表root, L 代表leaf。

参考基因组选择日本晴。

数据位置：

参考基因组:/share/bioinfo/miaochenyong/call_snp/Osativa_204.fa

p1:/share/bioinfo/miaochenyong/call_snp/parent1/

p2:/share/bioinfo/miaochenyong/call_snp/parent2/

f1:/share/bioinfo/miaochenyong/call_snp/hybrid/

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原文地址：http://www.cnblogs.com/freemao/p/3792501.html