`MEGAN（Metagenome Analyzer） Diamond+MEGAN6`已经是一套比较完整的物种和功能注释流程了。 但是由于各种原因，我们在流程中使用的并非最新版。不同版本的 使用方法差别较大，尤其在命令行模式下。网上的关于这方面的资料也寥寥无几，这里简单记录下使用方法，主要是针对 平 ...
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2019-10-28 10:46:30
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这个需求真的太常见了！注意问题强调的几个关键词：一是快速，二是大量，三是差异明显。在生成大量元素比较图时要明显区分不同样本，比如宏基因组中的物种分析： 方法一：自定义 自定义颜色：优点是选择差异明显的颜色，缺点是费时费力，不知选多少种，眼睛都要挑花。 R的颜色板很多网站都可以查，随意搜一个贴上： " ...
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2019-08-16 00:35:54
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一、性能测试Ⅰ.测试方法微基准性能测试可以精准定位到某个模块或者某个方法的性能问题，例如对比一个方法使用同步实现和非同步实现的性能差异宏基准性能测试宏基准性能测试是一个综合测试，需要考虑到测试环境、测试场景和测试目标测试环境：模拟线上的真实环境测试场景：在测试某个接口时，是否有其他业务的接口也在平行运行，进而造成干扰测试目标可以通过吞吐量和响应时间来衡量系统是否达标，如果不达标，就需要进行优化如果
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2019-06-25 09:35:56
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一、性能测试 Ⅰ.测试方法 可以精准定位到某个模块或者某个方法的性能问题，例如对比一个方法使用同步实现和非同步实现的性能差异 宏基准性能测试是一个综合测试，需要考虑到测试环境、测试场景和测试目标 测试环境：模拟线上的真实环境 测试场景：在测试某个接口时，是否有其他业务的接口也在平行运行，进而造成干扰 ...
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2019-06-24 20:58:24
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之前我有过一篇16s基本概念和数据分析的文章。16S 基础知识、分析工具和分析流程详解 宏基因组测序 2010 - A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing - 王俊 华大基因前CEO王俊发表 ...
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2019-05-12 10:58:11
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起因：更新win10推送的更新补丁，失败自动回退。开机进度条只能走到75%，bios进不去，最后就卡在开机的logo。（还有其他人是win7直接升级win10，也出现了这种情况。）解决办法：重刷bios。重刷bios，我知道的有4种：1、直接在window系统下更新（系统已挂，此种情况行不通）2、盲 ...
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2018-07-05 00:34:37
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闲来无事，折腾机器。 硬件： CPU：amd x2450 Memory：6G 主板：09年的七彩虹 小板 MATX ：集成声、显、网卡：集成显卡是很老的Nvida ？470，一个小众的oem版本 HD：IDE转接SATA卡，接希捷160G的IDE硬盘 NO 光驱 Display：宏基23吋的，最佳分 ...
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2017-11-03 11:17:09
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shift+鼠标滚轮：实现左右移动 alt+鼠标左键双击：打开属性 chrome中在F12下的Element中，可以先选中某一项，可以直接按住F2进行编辑 chrome中element的右下方我们可以看一个元素的各种css属性，包括自身设置的还是继承而来的--通过此方法可以排查错误 宏基笔记本 按住 ...
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2017-08-11 12:16:05
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散点图 数据点在直角坐标系平面上的分布图。在宏基因组领域，散点图常用于展示样品组间的Beta多样性，常用的分析方法有主成分分析(PCA)，主坐标轴分析(PCoA/MDS)和限制条件的主坐标轴分析(CPCoA/CCA/RDA)。 Beta多样性 Beat多样性是生态学概念，专指不同组或生态位间物种组成 ...
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2017-08-03 00:54:15
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箱线图 箱形图（Box-plot）又称为盒须图、盒式图或箱线图，是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图。因形状如箱子而得名。在宏基因组领域，常用于展示样品组中各样品Alpha多样性的分布 箱线图 箱形图（Box-plot）又称为盒须图、盒式图或箱线图，是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图。 ...
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2017-08-01 23:14:19
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