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搜索关键字:repeated dna sequenc    ( 1509个结果
UVA11584---Partitioning by Palindromes(dp)
We say a sequence of characters is a palindrome if it is the same written forwards and backwards. For exam- ple, ‘ racecar ’ is a palindrome, but ‘ fastcar ’ is not. A partition of a sequenc...
分类:其他好文   时间:2015-05-21 22:45:42    阅读次数:229
hihocoder #1052 : 基因工程
时间限制:1000ms 单点时限:1000ms 内存限制:256MB 描述 小Hi和小Ho正在进行一项基因工程实验。他们要修改一段长度为N的DNA序列,使得这段DNA上最前面的K个碱基组成的序列与最后面的K个碱基组成的序列完全一致。   例如对于序列"ATCGATAC"和K=2,可以通过将第二个碱基修改为"C"使得最前面2个碱基与最后面两个碱基都为"AC"。当然还...
分类:其他好文   时间:2015-05-21 15:43:11    阅读次数:179
生物信息-DNA的双螺旋结构
生物信息学的研究重点主要体现在基因组学(genomics)和蛋白质组学(proteomics)两个方面,intron 内含子,exon外显子1.DNA的双螺旋结构双螺旋结构是基于对碱基配对规律的认识:氢键结合只发生于互补的碱基A与T、G与C之间。双螺旋分子两条链的严格互补性,是指一条链的核苷酸顺序,无例外地取决于另一条链。每一条DNA链都能作为模板,以合成一条准确地限定核苷酸顺序的新链,也是根据碱基...
分类:其他好文   时间:2015-05-18 11:02:26    阅读次数:222
[LeetCode]Repeated DNA Sequences Total
题意:题目意思很简单就是有一个由 A C G T 组成的字符串,要求找出字符窜中出现次数不止1次的字串 思路1: 遍历字符串,用hashmap存储字串,判断即可 代码1: public List findRepeatedDnaSequences(String s) { List rs = new LinkedList(); Map map = new...
分类:其他好文   时间:2015-05-16 16:37:47    阅读次数:179
accumarray
1 Example 1 2 3 4 Create a 5-by-1 vector and sum values for repeated 1-D subscripts: 5 val = 101:105; 6 subs = [1; 2; 4; 2; 4] 7 subs = 8 ...
分类:其他好文   时间:2015-05-16 13:19:31    阅读次数:91
LeetCode的medium题集合(C++实现)五
1 Combination Sum Given a set of candidate numbers (C) and a target number (T), find all unique combinations in C where the candidate numbers sums to T. The same repeated number may be chosen from C...
分类:编程语言   时间:2015-05-16 12:00:54    阅读次数:139
2015年“深圳杯”数学建模夏令营 B题:DNA序列的k-mer index问题
这个问题来自 DNA序列的k-mer index问题。 给定一个DNA序列,这个系列只含有4个字母ATCG,如 S =“CTGTACTGTAT”。给定一个整数值k,从S的第一个位置开始,取一连续k个字母的短串,称之为k-mer(如k= 5,则此短串为CTGTA), 然后从S的第二个位置, 取另一k-mer(如k= 5,则此短串为TGTAC),这样直至S的末端,就得一个集合,包含全部k-mer 。...
分类:其他好文   时间:2015-05-16 09:06:59    阅读次数:92
分布式数据库MVCC读写设计
分布式数据库数据表分成多个parition,分布在不同server上,拓扑是每个server维护不同的版本时间戳,相比单机数据库,提供MVCC要复杂很多,当然,你如果有spanner的原子钟,那会简单很多。现描述一种可行的实现方案,抛砖引玉。此方案可以做如下保证: 1.单Partition读(分分布式事务读)可以保重repeated read。 2同一个server上的分布式事务可以保证repeat...
分类:数据库   时间:2015-05-12 21:08:45    阅读次数:267
Linux基础-文字处理命令汇总(未完待续)
本文将总结如下命令:wc:wordcount-l:仅显示行数-w:仅显示字数-c:仅显示byte大小cut:(removesectionsfromeachlineoffiles)从文件的每行里删除固定的部分,用于匹配分隔符,然后筛选需要的列内容-d:指定分隔符-f:指定要显示的字段m:第m列m,n:第m和n列m-n:第m到第n列sort排序-f:..
分类:系统相关   时间:2015-05-12 19:05:44    阅读次数:184
2015年“深圳杯”数学建模夏令营-B题:DNA序列的k-mer index 问题
这是一个山科大的同学给我的一个问题,向我询问一下思路,对于数学建模,我没太多的了解,所以只能用计算机程序的方法来解答。 这是具体的问题: 这个问题来自 DNA序列的k-mer index问题。 给定一个DNA序列,这个系列只含有4个字母ATCG,如 S =“CTGTACTGTAT”。给定一个整数值k,从S的第一个位置开始,取一连续k个字母的短串,称之为k-mer(如k= 5,则此短串为C...
分类:其他好文   时间:2015-05-12 13:40:44    阅读次数:723
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