编辑距离，又称Levenshtein距离，是指两个字串之间，由一个转成另一个所需的最少编辑操作次数。许可的编辑操作包括将一个字符替换成另一个字符，插入一个字符，删除一个字符 实现方案： 1. 找出最长公共子串长度 参考代码： apache commons-lang ...
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2016-11-02 18:08:42
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http://www.cppblog.com/mysileng/archive/2012/11/30/195841.html 最长递增子序列问题：在一列数中寻找一些数，这些数满足：任意两个数a[i]和a[j]，若i<j，必有a[i]<a[j]，这样最长的子序列称为最长递增子序列。 设dp[i]表示以 ...
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2016-10-27 01:08:01
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题目链接：51nod 1183 编辑距离 1 #include<cstdio> 2 #include<cstring> 3 #include<algorithm> 4 using namespace std; 5 const int N = 1001; 6 char a[N], b[N]; 7 in ...
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2016-10-22 17:39:00
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题目链接：http://noi.openjudge.cn/ch0206/2988/ 题解： 首先，题目有误，少了一个添加操作 和求解LCS之类的思路类似 f[i][j]表示a序列中1..i的部分和b序列中1...j的部分的编辑距离，得： （1）i==0，j==0时，f[i][j]=0； （2）i== ...
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2016-10-21 00:55:12
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sam格式很精炼，几乎包含了比对的所有信息，我们平常用到的信息很少，但特殊情况下，我们会用到一些较为生僻的信息，关于这些信息sam官方文档的介绍比较精简，直接看估计很难看懂。 今天要介绍的是如何通过bam文件统计比对的indel和mismatch信息 首先要介绍一个非常重要的概念--编辑距离 定义：... ...
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2016-10-19 19:15:53
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最小编辑距离，动态规划经典题。 Given two words word1 and word2, find the minimum number of steps required to convert word1 to word2. (each operation is counted as 1 ...
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2016-09-28 01:23:20
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问题一：字符串s1与字符串s2之间的编辑距离为：将s1转换成s2的最少步数，转换过程可以进行的操作有： 1.插入一个字符 2.删除一个字符 3.替换一个字符 我们用f[i][j]表示s1[0,i]前i个字符组成的字符串，和s2[0,j]前j个字符组成的字符串，之间的编辑距离。若s[i-1]==s[j ...
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2016-09-17 00:14:10
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描述： Levenshtein 距离，又称编辑距离，指的是两个字符串之间，由一个转换成另一个所需的最少编辑操作次数。许可的编辑操作包括将一个字符替换成另一个字符，插入一个字符，删除一个字符。编辑距离的算法是首先由俄国科学家Levenshtein提出的，故又叫Levenshtein Distance。 ...
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2016-09-12 23:54:51
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在“文本比较算法Ⅰ——LD算法”中介绍了基于编辑距离的文本比较算法——LD算法。 本文介绍基于最长公共子串的文本比较算法——Needleman/Wunsch算法。 还是以实例说明：字符串A=kitten，字符串B=sitting 那他们的最长公共子串为ittn（注：最长公共子串不需要连续出现，但一定 ...
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2016-09-11 12:52:06
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