cuffdiff： cuffdiff的输入 1. bam文件 2. control和treat两组样本。每组可包含一个或多个样本。 若执行：cuffdiff c1,c2,c3 t1,t2,t3，则得到1个差异列表。 若分别执行：cuffdiff c1 t1 cuffdiff c2 t2 cuffdi ...
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2019-10-21 16:10:20
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今天咪咪姑姑要走了。前几天拿到了奶奶的骨灰，说是灰，其实是骨头的残片。骨壁都有完整保留，其它没钙化的有机质都没有了。能看到清楚的头盖骨片、脊椎、指骨这些，别的我们的生物学知识就分不出来了。咪咪咕咕和元元姑姑，各带走一点残片回美国。咪咪咕咕感叹说：“之后我就不回来了”，颇有一种家破人散的感觉；不过我想，我邀请咪咪姑姑和她的孩子们来北京，应该还是可以的吧。.CIKERS数据系统的架子，汪小萍已经做好了
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2019-10-15 17:35:29
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题目： 大数据时代下基于网络算法和机器学习的非编码RNA 相关预测研究摘要：最近越来越多的生物实验表明非编码RNA 具有非常重要的生物学功能，参与细胞中的多项重要生命活动，调控许多基本且重要的生物过程。通过这些调控过程，非编码RNA 与人类疾病密切相关。深入研究非编码RNA 的生物功能与调控机制，进 ...
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2019-10-12 11:11:22
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何为功能富集分析？ 功能富集分析是将基因或者蛋白列表分成多个部分，即将一堆基因进行分类，而这里的分类标准往往是按照基因的功能来限定的。换句话说，就是把一个基因列表中，具有相似功能的基因放到一起，并和生物学表型关联起来。 何为GO和KEGG？ 为了解决将基因按照功能进行分类的问题，科学家们开发了很多基 ...
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2019-10-11 20:33:34
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大数据时代背景简介： 最早提出大数据时代到来的是全球知名咨询公司麦肯锡， 大数据在物理学、生物学、环境生态学等领域以及军事、金融、通讯等行业存在已有时日， 却因为近年来互联网和信息行业的发展而引起人们关注。 大数据作为云计算、互联网之后又IT行业又一大颠覆性的技术革命。云计算主要为数据资产提供了保管 ...
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2019-09-21 21:38:32
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类、对象、实例的关系是什么，如果不能很好的理解什么是类什么是对象就无法讲清楚， 类：某种事物与另一种事物具有相似性，比如哈士奇和泰迪，我们发现他们有一些相似的特性和行为，在生物学上，他们都属于“狗”，狗都会什么呢？他们都会叫、有四条腿等等，我们把这种具有相同属性和行为的事物就叫做类，就是我们常说的“ ...
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2019-09-21 18:46:08
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【题目描述】： 21 世纪是生物学的世纪，以遗传与进化为代表的现代生物理论越来越多的进入了我们的视野。 如同大家所熟知的，基因是遗传因子，它记录了生命的基本构造和性能。因此生物进化与基因的变异息息相关，考察基因变异的途径对研究生物学有着至关重要的作用。现在，让我们来看这样一个模型： 1、所有的基因都 ...
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2019-09-16 00:04:36
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可变剪接（alternative splicing）,在真核生物中是一种非常基本的生物学事件。即基因转录后，先产生初始RNA或称作RNA前体，然后再通过可变剪接方式，选择性的把不同的外显子进行重连，从而产生不同的剪接异构体（isoform）。这种方式，使得一个基因可产生多个不同的转录本，这些转录本分... ...
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2019-09-10 12:57:43
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生物统计与实验设计-绪论 重点在于理解统计学含义而非掌握各种处理方法的细节，同时加入各种视角，无论在统计学还是生物学方面。 除统计学教材外，推荐了以下书籍： 其中， 女士品茶：经典统计学历史（客观），可以通过历史明白如今的统计学框架的来源，以此从人的角度理解它。 数理化通俗演义：故事格局和横向视角 ...
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2019-09-04 00:36:30
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一、LCS定义 ? 最长公共子序列（Longest Common Subsequence）? 一个序列S任意删除若干个字符得到的新序列T，则T叫做S的子序列? 两个序列X和Y的公共子序列中，长度最长的那个，定义为X和Y的最长公共子序列 – 字符串12455与245576的最长公共子序列为2455 – ...
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2019-09-03 16:13:54
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