四、基于序列数据的生物进化研究的挑战 解密后由表象进化到分子进化。 构建进化树的步骤： 序列相似性比较 序列同源性比较 构建系统进化树 稳定性检验,因为必须是保守序列。 序列相似性比较。就是将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较，用于确定该序列的生物属性，也就是找出与此序列相似的已知序列是什么。 ...
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2019-11-20 12:59:17
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马上要修考出愿了 需要给导师再submit一份研究计划书， 根据之前导师的期望，硕士阶段的学习主要针对GAN在蛋白质设计方面的应用 所以在复习数学和专业课的百忙之中啊，必须再肝一份新的研究计划书出来， 首先从经典的GAN入手，再学习一下WGAN，然后就开始考虑自己在这方面的想法。 GAN GAN主要 ...
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2019-10-29 19:40:26
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1. Maxquant的iBAQ和LFQ，该用哪个？我们使用Maxquant做Label Free蛋白质组学定量分析的时候，在Maxquant的参数设置时，会遇到两个参数，LFQ和iBAQ，那么，选择哪个好呢？如果你都选上，在最终的proteingroups.txt中，会出现三列：Intensity ...
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2019-10-21 13:16:25
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Entrez是一个搜索引擎，国家生物技术信息中心（NCBI）网站集成了 几个健康科学的数据库，如：如“科学文献，DNA和蛋白质序列数据库， 蛋白质三维结构，蛋白质结构域的数据，表达数据，基因组完整拼接本等。 Entrez的编程工具”（eUtils）：通过它把搜索的结果返回到自己编写的程序里面， 需要 ...
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2019-10-20 11:25:10
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文献名：Proteomic analysis of Rhizobium favelukesii LPU83 in response to acid stress.（酸胁迫下根瘤菌LPU83（Rhizobium favelukesii）的蛋白质组学分析） 期刊名：Journal of Proteome ...
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2019-10-17 11:49:44
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生物医学大数据-蛋白质定量 现今肽段定量效率存在巨大差异。比如相同质量蛋白质，但是肽段和蛋白信号不均一，在物理条件一致时，仅有70%的重复率，并且当重复次数变多时，overlapping在变少。 无标定量法 方法一是针对二级色谱的谱图计数，即统计二级色谱的数量，数量越多则蛋白丰度越高，但相同丰度蛋白 ...
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2019-10-13 19:10:42
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生命组学 将密码子表重排后发现，嘌呤嘧啶含量不同，密码子的氨基酸种类由第一二位决定，同时第三位变化大却没有蛋白质层面上实质性的改变，这说明第三位氨基酸是用于维持氨基酸组成不发生变化同时保证蛋白质稳定性。 基于最小损伤原则，AU-rich半区为多样性半区，这里的氨基酸是必须的氨基酸且种类繁多。GC-r ...
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2019-10-13 18:56:49
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一、基因 基因：事物如斯的根本（基本）原因。 基因（遗传因子）是产生一条多肽链或功能RNA所需的全部核苷酸序列。基因支持着生命的基本构造和性能。储存着生命的种族、血型、孕育、生长、凋亡等过程的全部信息。环境和遗传的互相依赖，演绎着生命的繁衍、细胞分裂和蛋白质合成等重要生理过程。生物体的生、长、衰、病 ...
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2019-10-10 15:52:49
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质谱仪： 质谱分析法是先将大分子电离为带电粒子，按质核比分离，由质谱仪识别电信号得到质谱图。 Top-down直接得到结果是蛋白。 Bottom down使用shutgun方法得到结果是肽段。 由蛋白质混合物打断为肽段混合物，按特定时间分离为LC， 初次得到的谱图为一级谱，一级谱是串联质谱，其中一个 ...
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2019-10-01 22:20:31
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如果你是 #素食者，推荐 豌豆蛋白；如果要 #喂宝宝喝奶，推荐 水解乳清蛋白；给家里 #老人补充蛋白质，推荐 水解乳清蛋白；如果你想 #增肌，推荐 乳清蛋白再加一罐酪蛋白；#乳糖不耐受# 的朋友，推荐 乳清分离蛋白；如果你 #筋骨不好，推荐 胶原蛋白； 如果你预算不足又想补充蛋白，那就多吃鸡蛋呀！ ...
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2019-09-26 21:25:03
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