pyvcf 中带的一个工具 比其他工具用着好些 其他filter我很信不过~~ 自己写的功能又很有限 所以转投vcf_filter.py啦Filtering a VCF file based on some properties of interest is a common enough oper...
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2014-08-19 10:54:24
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最近一直在处理samtools freebayes gatk 产生的snp数据， 结果文件都是vcf，于是自己就写了相应的类，但是总是不够完善。 海宝推荐这个模块，他都推荐了 我还抱着我那烂代码不放干啥 之前写的就当练习类了安装：sudo pip install pyvcf然后报错说没有counte...
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2014-08-18 20:13:42
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经过几天的摸索和网上资料的查询对GATK软件有点小心得，现总结如下：
1. fasta文件最好用定位到染色体上的数据，可以不用注释VCF文件（GVF），但如果用VCF文件保证以下几个条件：
1）VCF染色体必须和fasta的染色体数目一致，顺序一致
2）VCF的位点必须从小到大排序
3）VCF的碱基有可能有其他符号，如“~”等，要去除干净
2. 做之前分别使用picard...
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2014-08-02 12:53:13
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Android vcard使用示例，生成vcf文件 我们备份手机联系人时，导出到SD卡时，会在SD卡中生成一个vcf文件，用于保存联系人姓名，手机号码。vCard 规范容许公开交换个人数据交换 (Personal Data Interchange PDI)信息，在传统纸质商业名片可找到这些信息。规范...
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2014-07-03 10:12:25
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vcf, 通讯录导出的一种格式。一。生成vcf文件如果要把我们iPhone通讯录里的数据, 生成vcf格式文件。我们可以借助iCloud。 小技巧：通过iCloud导出iPhone通讯录的方法当然, 如果你想在应用中, 利用代码生成, 完全可以。先导出通讯录数据, 再解析, 再生成vcf文件即可。参考下面代码:-(NSString*)generateVCardStringWithContacts...
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移动开发 时间：
2014-06-11 06:11:40
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前段时间我哥备份手机通讯录备份的是xls表格格式（我也不知道为什么要导出成这样的，，，汗死），然后现在导入不进去了，用各种软件都是错误。我导出为vcard的（后缀是vcf），以文本格式打开看了下，发现是很有格式规范的，顿时觉得有戏了。
BEGIN:VCARD
N:;移动客服;;;;;;
TEL;CELL:10086
STARRED:False
UID:514
VERSION:3.0
REV:20...
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移动开发 时间：
2014-06-02 15:07:50
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370
