一、题目要求 二、题目背景 动态规划（英语：Dynamic programming，简称 DP）是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和生物信息学中使用的，通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法。 动态规划常常适用于有重叠子问题和最优子结构性质的问题，动态规划方法所耗时间往往 ...
分类：
其他好文 时间：
2019-12-06 11:46:37
阅读次数：
91
欢迎来到"bio生物信息"的世界 BMC Bioinformatics前几天发布了一个画曼哈顿图的工具 , 这个名字很好理解，Manhattan的升级版。 这个工具与之前画曼哈顿图的工具有什么区别呢。 最大的特点是能将显著的位点以及注释信息显示在曼哈顿图上。 可视化很漂亮，特别有高级感。 好了，以下 ...
分类：
其他好文 时间：
2019-12-01 16:47:47
阅读次数：
599
生物信息学 Cell theory:7个要点 All known living things are made up of one or more cells. All living cells arise from pre-existing cells by division. The cell ...
分类：
系统相关 时间：
2019-11-06 13:05:16
阅读次数：
168
隐马尔科夫模型是一种序列模型，广泛应用于自然语言处理，语音识别，生物信息等领域。 1. 模型的定义与约定： 定义：一个隐马尔科夫模型指的是如下的两个随机序列$I,O$： 1）一个不可观测随机序列：$I=(i_{1},...,i_{T})$, 可以取值状态集合$Q=\lbrace 1,...,K\rb ...
分类：
其他好文 时间：
2019-11-02 00:31:05
阅读次数：
105
variant和gene expression是生物信息中两个非常重要的核心站点（根据中心法则，还有表观、3D genome、isoform、蛋白），这也是两个最能被准确测量的维度，在Post-GWAS，它们两的关系是我们研究的重点。 显然variant主要分为两类： coding noncodin ...
分类：
其他好文 时间：
2019-11-01 22:24:37
阅读次数：
119
生物信息：找出基因，生物学家使用字母A、C、T和G构成的字符串建模一个基因组。一个基因是基因组的子串，它从三元组ATG后开始在三元组TAG、TAA或TGA之前结束。此外，基因字符串的长度是3的倍数，而且基因不包含三元组ATG、TAG、TAA和TGA。编写程序提示用户输入一个基因组，然后显示基因组里的 ...
分类：
编程语言 时间：
2019-10-27 16:24:11
阅读次数：
780
计算生物学，生物信息学，计算生物信息学 杂志 期刊 BMC BioinformaticsBMC Genomics BMC System Biology BMC subs BRIEFINGS IN BIOINFORMATICSBioinformaticsCOMPUTATIONAL BIOLOGY AN ...
分类：
其他好文 时间：
2019-10-25 10:02:40
阅读次数：
146
老师要做一个关于生物信息工程的网站，一个同学要负责网站的搭建，让我来研究blast。但是这个软件的教程太少了，在看的过程中走了不少弯路。写个文章记录一下，以便以后使用。同时还会根据项目的进程进行更新。 2019/10/24 一、说明 Blast，全称Basic Local Alignment Sea ...
生物医学大数据： 参考书： 信息学是研究数据生命周期的学科，所以生物信息学是研究生物数据生命周期的学科。 Data-information-knowledge-wisdom 37-37℃--fever--prediction or deal with (medicine) Descriptive|p ...
分类：
其他好文 时间：
2019-10-24 18:19:34
阅读次数：
96
生物信息学 Contig是reads拼成的连续的DNA片段，连续表达一个gene。通过双端测序的contig可确定contig之间的关系得到scaffold，Scaffold是reads拼成的有gap的DNA片段。理想情况下，一条染色体用同一个scaffold的表达。整个genome存在很多零碎片段 ...
分类：
编程语言 时间：
2019-10-23 13:22:54
阅读次数：
106
