我是生物信息学学生，关于编程语言也学了几种，总觉得不太好用，听他们说Python的话还好点，并且也是现在比较热门的，所以非常感兴趣选了肖老师的Python（班里的同学上学期修过，非常非常推荐）。我希望在老师的课堂上感受到的是学会编程的乐趣，而并不是为了解决各种事情去学习，所以无论涉及到哪一方面对于我 ...
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2019-03-11 13:11:33
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注：从进入生信领域到现在，已经过去快8年了。生物信息学包含了我最喜欢的三门学科：生物学、计算机科学和数学。但是如果突然问起，什么是生物信息学，我还是无法给出一个让自己满意的答案。于是便有了这篇博客。 起源 据说在1970年，荷兰科学家Paulien Hogeweg和Ben Hesper最早在荷兰语中 ...
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2019-02-22 21:35:49
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1、简单介绍 BeeBase是一个在线生物信息学数据库，显示与Apis mellifera、欧洲蜜蜂以及一些病原体和其他物种有关的数据。它是与蜜蜂基因组测序联盟合作开发的。BeeBase是蜜蜂研究社区的一个综合序列数据源。目前寄主的基因组有蜜原Apis及其三种病原菌，以及Bombus terreli ...
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2019-01-25 21:42:05
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资源链接：https://pan.baidu.com/s/15W1jfylzBaR9debSJns5UA《Python生物信息学数据管理》中文版PDF，带书签，337页。《Python生物信息学数据管理》英文版PDF，带书签，556页。两版对比学习。配套源代码。生物信息学经典资料，解决生物学问题，通过“编程技法”的形式，涵盖尽可能多的组织、分析、表现结果的策略。在每章结尾都会有为生物研究者设计的编
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2018-11-28 12:18:58
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使用Tophat+cufflinks分析差异表达 2017-06-15 19:09:43 522 0 0 使用TopHat+Cufflinks的流程图 序列的比对是RNA分析流程中核心的一步。序列的比对，或者说是字符串的比对本身就是计算机科学中的一个经典问题，在生物信息学中更加频繁的出现。序列比对中 ...
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2018-11-09 22:55:58
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一： 简答：研究内容： n 数据管理层面上：开发、设计一系列相关的工具，能够方便有效的获取、管理以及使用各种类型的数据和信息。 n 算法开发层面上：开发新的算法及统计学的方法来揭示大规模数据之间的联系。 n 研究对象层面上：分析和解释各种类型的生物学数据，包括核酸、氨基酸序列、蛋白质功能结构域以及蛋 ...
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2018-11-07 23:04:21
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数据分析流程 来自知乎孟浩巍的“快速入门生物信息学的”Live，超棒的~ 首先是质控部分，使用fastqc进行对结果分析。 对于Illumia二代测序的结果质控包括两个方面，去掉测序质量不好的序列，即Quality Control；二是需要去掉连在玻璃上的短的接头，cut adaptor。 -t 8 ...
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2018-10-20 11:45:12
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什么是转录因子？ 转录因子 转录因子基本介绍 什么是转录因子？ 转录因子（Transcriptionfactor，TF)是一个能与特异DNA序列结合的蛋白,可以单独或与其他蛋白形成复合体，提高或阻断特性基因对RNA聚合酶的招募,调控着基因的表达。转录因子特点是它包含一个或多个DNA结合域（DNA-b ...
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2018-10-19 02:11:35
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什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 随着ome为词尾的各种组学的出现，转录组学已经成为了人们了解生物信息的一个重要组成部分。人们使用了许多办法来掌握转录组的情况，主要分为两类，一类是基于杂交，一类是基于下一代测序技术(Next Generat ...
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2018-10-18 23:55:36
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生物信息学——RNA的剪切过程 外显子（exon expressed region）是真核生物基因的一部分，它在剪接(Splicing)后仍会被保存下来，并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。 外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列，又称表达序列。既存在于最初的转录产物中，也存在于成熟的RNA ...
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2018-10-15 23:17:20
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