重测序便宜了，群体的测序和分析也多了起来。群体结构分析，是重测序最常见的分析内容。群体结构分析应用十分广泛，首先其本身是群体进化关系分析里面最基础的分析内容，其次在进行GWAS分析的时候，本身也需要使用PCA或structure分析的结果作为协变量，来校正群体结构对关联分析带来的假阳性。我们之所以冠 ...
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2016-12-12 02:05:22
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Resequencing 302 wild and cultivated accessions identifies genes related to domestication and improvement in soybean 中文名：基于GWAS与群体进化分析挖掘大豆驯化及改良相关基因 发表 ...
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2016-12-09 16:39:48
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1、在linux中安装好R 2、准备好画曼哈顿图的R脚本即manhattan.r，manhattan.r内容如下： 3、准备好plink跑完后的.assoc.linear文件，比如mydata.assoc.linear 4、在linux中输入以下一个命令： 其中，mydata.png即为我们想要的曼 ...
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2016-11-24 07:16:06
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全基因组关联分析流程： 一、准备plink文件 1、准备PED文件 PED文件有六列，六列内容如下： Family ID Individual ID Paternal ID Maternal ID Sex (1=male; 2=female; other=unknown) Phenotype PED ...
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2016-11-23 22:38:48
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在前一篇《Speed-BI多事实表与表间计算的应用（excel多Sheet关联分析）：销售目标达成分析》http://www.powerbibbs.com/forum. ... 7583&extra=page%3D1里我们说到当有一个明细的“门店销售”的明细数据（图1），<ignore_js_op> ...
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2016-11-17 17:52:17
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GCTA(全基因组复杂性状分析)工具开发目的是针对复杂性状的全基因组关联分析，评估SNP解释的表型方差所占的比例(该网站地址：http://cnsgenomics.com/software/gcta/)。目前GCTA工具可实现以下功能： 1 评估全基因组SNP的亲缘关系（遗传关系） 2 评估全基因组 ...
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2016-10-22 00:17:22
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0序 随着移动互联和大数据的拓展越发觉得算法以及模型在设计和开发中的重要性。不管是现在接触比较多的安全产品还是大互联网公司经常提到的人工智能产品（甚至人类2045的的智能拐点时代）。都基于算法及建模来处理。 常见的词汇：机器学习、数据建模、关联分析、算法优化等等，而这些种种又都是基于规律的深度开发（ ...
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2016-10-15 19:14:12
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一. 概念 关联分析用于发现隐藏在大型数据集中的有意义的联系。所发现的联系可以用关联规则（association rule）或频繁项集的形式表示。 项集：在关联分析中，包含0个或多个项的集合被称为项集（itemset）。如果一个项集包含k个项，则称它为k-项集。例如:{啤酒，尿布，牛奶，花生} 是一 ...
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2016-08-16 22:00:15
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本书全面介绍了数据挖掘，涵盖了五个主题：数据、分类、关联分析、聚类和异常检测。除异常检测外，每个主题都有两章。前一章涵盖基本概念、代表性算法和评估技术，而后一章讨论高级概念和算法。这样能够在透彻地理解数据挖据的基础的同时，还能够了解更多重要的高级主题。 目录 第1章 绪论 1.1 什么是数据挖掘 1 ...
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2016-08-08 06:23:30
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MIC:the Maximal Information Coefficient,是用网格分法判断数据的集中程度的一个标准。 ...
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2016-08-07 06:13:29
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