poj 4092:牛仔裤
题目：
描述
基因地理计划是IBM和美国国家地理学会的合作研究项目，用来分析来自于数十万的捐助者的DNA，来研究人类在地球上的迁移图。
作为一个IBM的研究者，你被要求写一个程序，来发现共性的DNA片段，用来和个人调查信息关联以确定新的遗传标记。
DNA碱基序列通过按顺序排列分子中发现的含氮碱基来记录。有四种碱基：腺嘌呤（A），胸腺嘧啶（T），鸟...
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2014-10-25 10:35:02
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1.格式uniq [OPTION]... [INPUT [OUTPUT]]2.命令 -c, --count prefix lines by the number of occurrences -d, --repeated o...
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2014-10-21 17:29:14
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[leetcode]Given a set of candidate numbers (C) and a target number (T), find all unique combinations in C where the candidate numbers sums to T.The same repeated number may be chosen from C unlimited number of times....
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2014-10-21 12:22:27
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题意：
给N个单词，再给一个串str （只含A、G、C、T）
问对于str要至少修改几个字符能不含有N个单词
思路：
建立trie图，做自动机dp
dp[i][j] 代表走过str的i个字母在j节点至少需要修改几个字符
trie *p=node[j]->next[k];
if(p->mark) continue; //不可达
dp[i][p->id]=min(dp[i][...
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2014-10-15 14:43:30
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Common Subsequence
Time Limit: 1000MS
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Description
A subsequence of a given sequence is the given sequenc...
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2014-10-13 15:02:29
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题目链接:http://poj.org/problem?id=3691题目大意：给定N的致病DNA片段以及一个最终DNA片段。问最终DNA片段最少修改多少个字符，使得不包含任一致病DNA。解题思路：首先说一下AC自动机在本题中的作用。①字典树部分：负责判断当前0~i个字符组成的串是否包含致病DNA，...
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2014-10-11 03:07:44
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1、双脱氧链末端终止法基本原理：双脱氧链末端终止法通过使用链终止剂—类似于正常dNTP的2’,3’-双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)，将延伸的DNA链特异性地终止。其反应体系也包括单链模板、引物、4种dNTP和DNA聚合酶。共分四组，每组按一定比例加入一种(ddNTP)，它能随机渗入合成的DNA链，一...
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2014-10-10 15:03:54
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字符串匹配是经常遇到的问题，比如信息检索、拼写检查，甚至是生物信息学中DNA相关的问题。1、比较简单的匹配算法是直接暴力匹配，算法原理：1)取指针i，j分别指向字符串S和目标串P，如果S[i] == P[j]，i和j分别自增。2)如果不相等，i回溯到初始位置的下一个位置，即i = i - j + 1...
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2014-10-07 22:05:14
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题目大意：
给出很多个DNA串，每一个串的价值为1，最后给出一个长串，要你重新排列最后的串使之它所有的子串的权值和最大。
思路分析：
最先容易想到的思路就是搜！管她3721。。直接一个字符一个字符的码，然后在AC自动机上判断最后的权值。TLE哟。
然后发现搜过不去，那就dp咯。再容易想到的就是dp[i][a][b][c][d] 表示此时遍历AC自动机的节点在i，然后构成了a个A，b...
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2014-10-02 19:52:33
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题目大意：
给出的DNA序列有一个权值，请构造一个长度为I的DNA序列使得在这段DNA序列的权值最大。如果为负数就输出噼里啪啦。。。
思路分析：
构造序列就是在ac自动机上走，求最大要用到dp
dp[i][j][k] 表示现在构造到了长度 i 。此时的我们把当前字符放在j节点，并且满足了k状态。k是一个10位的2进制状态压缩。
注意这道题上有坑就是一个序列可能有多个权值。所以不能...
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2014-10-02 15:44:43
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