1.blastn: $blastn -query file-in -db database -out file_out -evalue 0.00001 -max_target_seqs 5 -num_threads 4 -outfmt format "7 qacc sacc evalue lengt ...
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2017-06-19 22:47:13
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用过的比对软件不多,只知道简单的全局比对和局部比对算法,比对软件的原理基本是不知道的。 现在用过的比对软件: bwa bowtie blasr blast blat 慢慢积累,比较这些软件的不同,因为生物信息最底层的就是比对,测序拿到一堆序列,第一件要做得事情就是比对。 先看一篇好文:Aligner... ...
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2016-11-25 11:36:31
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在桌面虚拟化这个技术门类中,市面上一共主流有以下几种协议:Citrix的ICA/HDX协议Teradici公司的PCoIP(VMwareHorzion中主要使用的协议之一)微软公司的RDPRedHat公司的spice以及近两年我们能接触到的VMware公司的Blast(VMware在Horizion6版本以后开始提供的协议,有逐步替代..
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2016-10-09 21:04:21
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1、把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下;2、制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /home/username/blast/bin;3、在当前用户目录下,编辑bashrc文件,在文件中加入e ...
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2016-09-27 18:07:09
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问圆和多边形相交,什么时候比例可以是一个定值。 二分加模板,可就是过不了。。。伤心。。。帖一发新模板,意思都一样,真是纠结了。 http://tokers.cn/2015/10/08/lightoj1358-fukushima-nuclear-blast%e4%ba%8c%e5%88%86%e5%9 ...
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2016-09-13 13:09:48
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描述 设有字符串X,我们称在X的头尾及中间插入任意多个空格后构成的新字符串为X的扩展串,如字符串X为“abcbcd”,则字符串“abcb□cd”,“□a□bcbcd□”和“abcb□cd□”都是X的扩展串,这里“□”代表空格字符。如果A1是字符串A的扩展串,B1是字符串B的扩展串,A1与B1具有相同 ...
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2016-08-20 23:16:29
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详见:http://blog.shenwei.me/local-blast-installation/ Linux系统中NCBI BLAST+本地化教程 Linux系统中NCBI BLAST+本地化教程 Linux系统中NCBI BLAST+本地化教程 本文面向初学者(最好还是懂得基本的linux使 ...
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2016-08-15 10:03:47
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病毒攻击 blast变种 安全攻击的类型 被动攻击 : 中断 截获 主动攻击: 篡改 伪造 安全服务 保密 ,认证 , 完整性 , 不可否认 , 存取控制, 数据可用 安全机制 加密机制,数字签名机制, 访问控制机制, 数据完整性机制,认证交换,公证机制 加密技术 密码学发展阶段 专业术语 明文 密 ...
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2016-07-31 14:20:21
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2016年7月12日 星期二 --出埃及记 Exodus 15:8By the blast of your nostrils the waters piled up. The surging waters stood firm like a wall; the deep waters congeal ...
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2016-07-12 19:20:40
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>>>importos
>>>foriinos.walk("."):
...printi[0],"\n##",i[1],"\n##",i[2]
...
.#当前目录
##[‘fa‘,‘out‘]#当前目录中的子目录
##[‘meta_rna.sh‘,‘nohup.out‘,‘log.cpu‘,‘blast_seq.py‘]
./fa#第一个子目录
##[]#第一个子目录中的目录
##[‘assemblyar_new_..
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2016-06-30 11:05:09
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