自从武汉报告了未知流感病毒，相关科技工作者和疾病预防控制人员加班加点，第一时间分离了病毒，并测序了病毒基因组。相比于当年的SARS，这种进步是非常非常巨大的。所以我们能够以最快的速度拿到病毒基因组，下面是该病毒基因组和SARS病毒基因组的简单比较。结果仅供参考。武汉新冠状病毒基因组共有30473个碱基，SARS病毒基因组29751个碱基，通过blast比对二者基因组，有21905个碱基能够准确比对
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2021-01-02 11:40:14
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Why is Blast useful? With the use of BLAST, you can possibly correctly identify a species or find homologous species. This can be useful, for example, ...
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2020-03-19 10:43:54
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NCBI National Center for Biotechnology Information：美国国立生物技术信息中心，包含PubMed、GenBank、RefSeq、GEO这些数据库；搜索引擎：Entrez；比对工具：BLAST 详细介绍：除了建有GenBank核酸序列数据库(该数据库的数 ...
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2020-03-17 14:10:53
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Blast进行同源基因的寻找 参考博客： http://boyun.sh.cn/bio/?p=1849 https://www.bioinfo scrounger.com/archives/673/ 基于蛋白的比对结果，寻找某一个蛋白家族的同源基因，使用如下的参数 identity 30%； e v ...
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2020-03-06 11:02:20
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1.alter v. 改变，改动，变更 2.burst vi.n. 突然发生，爆裂 3.dispose vi. 除掉；处置；解决；处理(of) 4.blast n. 爆炸；气流 vi. 炸，炸掉 5.consume v. 消耗，耗尽 6.split v. 劈开；割裂；分裂 a.裂开的 7.spit ...
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2020-02-23 14:48:08
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2020.2.6 模拟赛（二） T1 阴云密布（改编） 题目描述 杰哥有三个属性：生命值，魔法值，能量值。杰哥有如下三种基本技能：充能，攻击，魔法。杰哥的初始生命值Ht1，能量值和魔法值为0。阿伟的初始生命值为Ht2。 战斗有n轮，每轮杰哥会发动3个基本技能（杰哥耍赖。 攻击Blast： 对于第i个 ...
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2020-02-06 23:29:25
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一、问题呈现 找到Streptomyces属里hrdb基因的启动子（hrdbp）的保守序列，希望以此推断出-10区和-35区。 二、过程 1、下载15-20条hrdb基因的启动子序列，并处理形成一个fasta文件 1.1、以coelicolor A3(2)的hrdb基因为源头，通过blast找到得分 ...
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2019-12-31 23:56:11
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老师要做一个关于生物信息工程的网站，一个同学要负责网站的搭建，让我来研究blast。但是这个软件的教程太少了，在看的过程中走了不少弯路。写个文章记录一下，以便以后使用。同时还会根据项目的进程进行更新。 2019/10/24 一、说明 Blast，全称Basic Local Alignment Sea ...
当database是10个物种（A、B、C、E、F、G、H、J、I、K）时，进行all vs all 比对结果是： 此时reference是物种A的第一个基因：即用10个物种的genome中的所有基因比对物种A的基因1 eg：如下 1.Sequences producing significant ...
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2019-08-07 19:01:59
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BLAS(Basic Linear Algebra Subprograms)是一组线性代数计算中通用的基本运算操作函数集合[1]?。BLAS Technical (BLAST) Forum负责规范BLAS函数接口,?并在网站[1]公布一个由Fortran语言编写的BLAS库。这个Fortran版BL ...
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2019-03-01 09:40:06
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