blast结果5个GsimilarSequences.txt 2.5G运行失败，提示表的行数超过最大值，文件大小超过最大值。需修改/etc/mysql/my.cnf将myisam_sort_buffer_size = 8M修改为myisam_sort_buffer_size = 64M添加myisa...
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2015-01-02 09:41:04
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from: https://secure.clcbio.com/helpspot/index.php?pg=kb.page&id=113Can I run a local BLAST search again multiple blast databases simultaneously? (bla...
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2014-12-01 12:45:55
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In this context, ‘local’ means you are running BLAST on your own server, not at NCBI or anyone else’s server. This gives you the flexibility of compar...
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2014-10-17 00:02:03
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最近要跑菠萝整个基因组的ahrd, 要做大量的blast, 但是恰好有个同学在使用cpu， 我的任务是比较重要的，所以想让cpu优先跑我的进程。优先值（值越小级别越高） = 优先系数（不可更改） + nice值（可手动更改）nice值的范围是-20到19所以想调整成最高优先级的话，将nice值设为-...
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2014-10-03 20:15:55
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Hmmer的安装与使用 从功能基因研究的角度来讲，相关的搜索，比如从序列数据库中，找同源的序列，或者对一个对一个新的基因功能进行鉴定，使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度，但其应用还远没有blast普及。hmmer下载与安装对于Mac OS/X, Linux, UNI.....
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2014-09-19 20:55:26
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Hmmer的安装与使用 从功能基因研究的角度来讲，相关的搜索，比如从序列数据库中，找同源的序列，或者对一个对一个新的基因功能进行鉴定，使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度，但其应用还远没有blast普及。hmmer下载与安装对于Mac OS/X, Linux, UNI.....
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2014-08-27 20:15:38
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转载的一篇关于blastall的文章，在使用的时候，还是要对应的看每个参数的意思，切记blast的运行分为两个步骤：第一，建立目标序列的数据库；第二，做blast比对。1、运行建库程序formatdb:建库的工程是建立目标序列的索引文件，所以程序是formatdb。程序允许的输入格式是FASTA或者...
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2014-07-07 08:18:56
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1 下载程序在ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/下载 ncbi-blast-2.2.25+-x64-linux.tar.gz2 解压 如解压到用户的主目录(/home/***)下，把解压后的文件夹重新命名为blast...
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2014-06-28 10:59:57
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update_blastdb.pl --showall
即可显示从NCBI上可下载的数据库名称获取方式：ncbi-blast-2.2.29+/bin目录下ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.2.29/
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2014-05-08 17:31:46
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