注：从进入生信领域到现在，已经过去快8年了。生物信息学包含了我最喜欢的三门学科：生物学、计算机科学和数学。但是如果突然问起，什么是生物信息学，我还是无法给出一个让自己满意的答案。于是便有了这篇博客。 起源 据说在1970年，荷兰科学家Paulien Hogeweg和Ben Hesper最早在荷兰语中 ...
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2019-02-22 21:35:49
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1、简单介绍 BeeBase是一个在线生物信息学数据库，显示与Apis mellifera、欧洲蜜蜂以及一些病原体和其他物种有关的数据。它是与蜜蜂基因组测序联盟合作开发的。BeeBase是蜜蜂研究社区的一个综合序列数据源。目前寄主的基因组有蜜原Apis及其三种病原菌，以及Bombus terreli ...
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2019-01-25 21:42:05
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资源链接：https://pan.baidu.com/s/15W1jfylzBaR9debSJns5UA《Python生物信息学数据管理》中文版PDF，带书签，337页。《Python生物信息学数据管理》英文版PDF，带书签，556页。两版对比学习。配套源代码。生物信息学经典资料，解决生物学问题，通过“编程技法”的形式，涵盖尽可能多的组织、分析、表现结果的策略。在每章结尾都会有为生物研究者设计的编
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2018-11-28 12:18:58
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使用Tophat+cufflinks分析差异表达 2017-06-15 19:09:43 522 0 0 使用TopHat+Cufflinks的流程图 序列的比对是RNA分析流程中核心的一步。序列的比对，或者说是字符串的比对本身就是计算机科学中的一个经典问题，在生物信息学中更加频繁的出现。序列比对中 ...
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2018-11-09 22:55:58
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一： 简答：研究内容： n 数据管理层面上：开发、设计一系列相关的工具，能够方便有效的获取、管理以及使用各种类型的数据和信息。 n 算法开发层面上：开发新的算法及统计学的方法来揭示大规模数据之间的联系。 n 研究对象层面上：分析和解释各种类型的生物学数据，包括核酸、氨基酸序列、蛋白质功能结构域以及蛋 ...
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2018-11-07 23:04:21
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数据分析流程 来自知乎孟浩巍的“快速入门生物信息学的”Live，超棒的~ 首先是质控部分，使用fastqc进行对结果分析。 对于Illumia二代测序的结果质控包括两个方面，去掉测序质量不好的序列，即Quality Control；二是需要去掉连在玻璃上的短的接头，cut adaptor。 -t 8 ...
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2018-10-20 11:45:12
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什么是转录因子？ 转录因子 转录因子基本介绍 什么是转录因子？ 转录因子（Transcriptionfactor，TF)是一个能与特异DNA序列结合的蛋白,可以单独或与其他蛋白形成复合体，提高或阻断特性基因对RNA聚合酶的招募,调控着基因的表达。转录因子特点是它包含一个或多个DNA结合域（DNA-b ...
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2018-10-19 02:11:35
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生物信息学——RNA的剪切过程 外显子（exon expressed region）是真核生物基因的一部分，它在剪接(Splicing)后仍会被保存下来，并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。 外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列，又称表达序列。既存在于最初的转录产物中，也存在于成熟的RNA ...
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2018-10-15 23:17:20
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生信研究内容 目前生物信息学 的研究情况来看，国际上公认的生物信息学的研究内容，大致包括以下几个方面： 1. 生物信息的收集、存储、管理与提供。包括建立国际基本生物信息库和生物 信息传输的国际联网系统；建立生物信息数据质量的评估与检测系统；生物信息的在线服务；生物信息可视化和专家系统。 2. 基因组 ...
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2018-10-15 23:11:50
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来自：生物信息学-陈铭第二版的一个例题。 题目： 目前的代码，运行不正确，关键就是不知道怎么回溯啊，回溯怎么标记呢？ #include <iostream> #include<vector> using namespace std; vector<char> s1,t1;//在回溯的时候使用 str ...
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2018-09-24 11:20:59
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