preface:明明在弄着NLP，突然看到python运维的书，随便翻翻，看到有用的包difflib，先记录下来。生物信息学关于不同蛋白质之间的结构对比的时候可能有用。difflib：实现两个字符串的差异对比，然后以版本控制风格进行输出。说是设计文件和目录差异对比、HTTP质量监控、邮件警告可以用得...
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2015-03-13 22:18:02
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Preface:CSDN博客突然打不开了，转到博客园来好了。最近在上生物信息学，查找工具的时候看到python的一个包ProDy，记录下来。prody包官网介绍：http://prody.csb.pitt.edu/ProDyProjectProDyis a free and open-source ...
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2015-03-13 18:33:14
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INTRODUCTION TO BIOINFORMATICS 这套教程源自Youtube,算得上比较完整的生物信息学领域的视频教程,授课内容完整清晰,专题化的讲座形式,细节讲解比国内的京师大学堂的Mooc教程好过10000倍.下面是视频的快速链接还有文档讲义哦,很好的东东,链接分享给国内的朋友们.=...
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2015-01-30 20:52:47
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博客：葡萄皮的个人博客--卢宏超（作者）http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=565112&do=blog&view=me&from=space&page=3在网上见到有一本书叫Python for Bioinfomatics, 作者是SE...
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2015-01-29 14:15:22
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条件随机场模型是Lafferty于2001年，在最大熵模型和隐马尔科夫模型的基础上，提出的一种判别式概率无向图学习模型，是一种用于标注和切分有序数据的条件概率模型。
CRF最早是针对序列数据分析提出的，现已成功应用于自然语言处理(Natural Language Processing，NLP） 、生物信息学、机器视觉及网络智能等领域。
1.序列标注的例子
标注（实体命名识别）：任命...
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2014-12-03 15:46:28
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Biometrika是牛津大学的周刊，重点是关注生物，数学，生物信息学http://biomet.oxfordjournals.org/
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2014-11-16 10:42:07
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国内1.翟中和2.邹承鲁国外罗伯特·加罗（Robert Gallo）-----HIV
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2014-10-25 10:24:52
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字符串匹配是经常遇到的问题，比如信息检索、拼写检查，甚至是生物信息学中DNA相关的问题。1、比较简单的匹配算法是直接暴力匹配，算法原理：1)取指针i，j分别指向字符串S和目标串P，如果S[i] == P[j]，i和j分别自增。2)如果不相等，i回溯到初始位置的下一个位置，即i = i - j + 1...
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2014-10-07 22:05:14
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分类决策树算法,其核心算法是ID3算法。目前应用在临床决策、生产制造、文档分析、生物信息学、空间数据建模等领域。算法的输入是带类标的数据，输出是树形的决策规则。...
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2014-09-24 13:42:06
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生物信息资源更新越来越快,使用可视化的方法来分析DNA序列已成为生物信息学的一个研究热点,用图形表示DNA序列的方法也越来越成熟。2011年，著名杂志《Science》发表一篇引起轰动的文章:《Presenting the Human Genome:Now is 3D!》,这篇文章完全给我们描述了人类基因组测序未来的蓝图，可见3D技术在很多领域都是发展方向。
使用mono可以快速的创建DNA分子结构立体模型。...
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2014-08-21 17:20:54
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