主要参考http://www.3fwork.com/b211/000091MYM021616/ Step 1 : sudo gedit /etc/apt/sources.list 添加到末尾 deb http://mirrors.xmu.edu.cn/CRAN/bin/linux/ubuntu xe ...
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2016-10-30 14:01:27
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恢复内容开始 上周20161021-20161028的任务还没有搞完，所以今天来填坑（微笑脸） ××××××××××××××××××××我是萌萌哒分割线×××××××××××××××××××× ...
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2016-10-30 13:53:49
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好吧，这是本周(2016.10.21-28)的学习任务之一：安装bowtie2并学习其使用方法&参数设置 所以，啃文档咯，官方文档Version 2.2.9 http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/manual.shtml ...
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2016-10-23 15:02:14
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其实好多东西装过好多次，然而每次都要翻文档，经常掉进前面掉进过的坑。。。所以这里重新写一份指南，以防下次再装又忘了（魂淡我并不想再装了啊不要立flag） 1. 安装biopython 1.1 因为biopython目前支持的是python2，所以我先把python调到2 1.2 安装numpy (h ...
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2016-10-23 11:29:43
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字符串匹配一直是计算机领域热门的研究问题之一，多种算法层出不穷。字符串匹配算法有着很强的实用价值，应用于信息搜索，拼写检查，生物信息学等多个领域。
今天介绍几种比较有名的算法：
1. BF
2. BM
3. Sunday
4. KMP—，BF算法
BF(Brute Force)算法又称为暴力匹配算法，是普通模式匹配算法。其算法思想很简单，从主串S的第pos个字符开...
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2016-05-07 07:21:50
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生物信息学专业类: 1.《python语言》 2.每月2篇SCI文章 经济类： 1.《国富论》（上、下） 2.《美国货币史》 心理类： 1.《少有人走的路Ⅱ：与心灵对话》 2.《少有人走的路Ⅲ：心灵地图》 市场营销类： 2本 产品经理类： 2本 人物传记类： 2本 其他： 《乔布斯演讲》 其他书10
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2016-02-18 13:38:53
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分子生物学主题词生物技术细胞生物学发育生物学遗传学生物信息学基因工程(en)转基因生物(en)干细胞疫苗细胞周期(en)细胞信号传导(en)细胞细胞骨架细胞器细胞膜生物学(en)信号传导老年胚胎学形态发生素(en)原肠胚形成(en)神经胚形成生长因子畸形成原(en)应用遗传学(en)染色体DNA遗传...
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2015-08-17 10:01:58
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1、背景 1993年，Agrawal提出了关联规则(Association Rule)问题，旨在发现顾客购货篮内商品间令人感兴趣的关系。 “啤酒和尿布” 沃尔玛利用NCR数据挖掘工具意外的发现：跟尿布一起购买最多的商品竟是啤酒！ 今天，关联规则已广泛应用于金融、营销以及生物信息学等领域。2...
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2015-05-27 13:40:34
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生物信息学的研究重点主要体现在基因组学（genomics）和蛋白质组学（proteomics）两个方面，intron 内含子，exon外显子1.DNA的双螺旋结构双螺旋结构是基于对碱基配对规律的认识：氢键结合只发生于互补的碱基A与T、G与C之间。双螺旋分子两条链的严格互补性，是指一条链的核苷酸顺序，无例外地取决于另一条链。每一条DNA链都能作为模板，以合成一条准确地限定核苷酸顺序的新链，也是根据碱基...
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2015-05-18 11:02:26
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preface：最近《生物信息学》多次谈到AUC，ROC这两个指标，正在做的project，要求画ROC曲线，sklearn里面有相应的函数，故学习学习。
AUC:
ROC:
具体使用参考sklearn:
http://scikit-learn.org/stable/modules/generated/sklearn.metrics.roc_curve.html
http://sciki...
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2015-04-17 18:21:40
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