注意数据库快照的创建样式 use YTDHPgocreate database test_shoton (name=YTHIS,filename='E:\test\YTHIS.snp'),(name=file2012,filename='E:\test\file2012.snp'),(name=fi ...
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2019-07-27 15:48:50
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Genotype-Tissue Expression Project (GTEx) Roadmap Epigenomics Project 这个研究的思路是什么？鉴定出有功能调控作用的变异。 对于复杂性状，通常会由很多遗传因素来控制，从而影响到表型。GWAS鉴定出了很多SNP，但是却只能解释部分he ...
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2019-05-03 13:01:21
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:或者1、简单介绍 固定指数(FST)是一种由遗传结构决定的种群分化指标。它通常是由遗传多态性数据，如单核苷酸多态性(SNP)或微卫星估计。作为莱特f统计的一个特例，它是种群遗传学中最常用的统计方法之一。 2、Definition 两个最常用的FST定义是基于群体间等位基因频率的方差，以及由血统决定 ...
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2019-01-28 01:23:03
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shapeit最大的功能是对双链DNA进行phase和基因型进行impute。除此之外，还能提取SNP和样本，同样的，也能去除SNP和样本。下面简单介绍这两个功能。 一、提取SNP 提取SNP用到“--include-snp”参数，具体命令为： 其中，include_marker.site为我们需要 ...
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2019-01-17 20:03:32
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一、合并文件 plink合并文件需要用到“merge”参数 如果是ped和map格式文件，则用以下命令： 如果是二进制文件和ped,map格式文件，则用以下命令： 如果都是二进制文件，则用以下命令： 二、更新SNP位置 假设更新 rs10002到位置580000，如下所示： 原始文件： 更新SNP位 ...
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2019-01-16 13:16:26
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?创建ConstraintViewDSL调用UIView 的 snp 方法，生成一个ConstraintViewDSL。注意这个生成的ConstraintViewDSL持有UIView。 创建ConstraintMaker调用makeConstraints，调用ConstraintMaker对应的静... ...
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2018-12-30 13:55:46
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将plink文件用“--recode HV ”的参数生成即可 ...
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2018-11-10 21:54:00
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在使用CDN资源时遇到这两个属性： crossorigin： integrity： 关于integrity的详细资料：https://imququ.com/post/subresource-integrity.html 参考：https://blog.csdn.net/SNP_fuyun/artic ...
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2018-11-06 17:42:45
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ADNI临床数据集: 由各个学科的临床信息组成，包括招募、人口统计特征、体格检查和认知评估数据 所收集的临床数据: 基因数据: ILLUMINA SNP基因分型检测 ADNI的一个关键目标就是为研究人员提供机会，将遗传学、影像学和临床数据结合起来，帮助研究该病的机制 SNPs 单核苷酸多态性（sin ...
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2018-10-24 20:21:33
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假设中性突变的频率分别为P和1-P，则其突变年龄为：-4Ne[p*( logep)+(1-p)* loge (1-p)] The average age of a neutral two-allele polymorphism with frequencies p and is 1-p：-4Ne[p ...
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2018-08-12 17:16:59
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