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搜索关键字:基因组    ( 230个结果
深度学习综述(LeCun、Bengio和Hinton)
原文摘要:深度学习可以让那些拥有多个处理层的计算模型来学习具有多层次抽象的数据的表示。这些方法在许多方面都带来了显著的改善,包括最先进的语音识别、视觉对象识别、对象检测和许多其它领域,例如药物发现和基因组学等。深度学习能够发现大数据中的复杂结构。它是利用BP算法来完成这个发现过程的。BP算法能够指导机器如何从前一层获取误差而改变本层的内部参数,这些内部参数可以用于计算表示。深度卷积网络在处理图像、...
分类:其他好文   时间:2015-06-04 12:04:45    阅读次数:373
深度学习(上)
深度学习允许由多个处理层组成的计算模型来学习多个抽象层数据的表示。这些方法大大提高了目前最先进的语音识别,可视对象识别,目标检测和其他诸多领域如药物发现和基因组。深度学习发现大数据集结构很复杂,该结构使用BP算法来指示机器应该如何改变内部参数,这些参数是用于从前一层的表示来计算每层的表示。深度卷积网已经在处理图像,视频,语音和音频方面取得了突破,而递归网已经触及到连续数据,如文本和语音。机器学习技术...
分类:其他好文   时间:2015-05-29 23:16:36    阅读次数:245
生物信息-DNA的双螺旋结构
生物信息学的研究重点主要体现在基因组学(genomics)和蛋白质组学(proteomics)两个方面,intron 内含子,exon外显子1.DNA的双螺旋结构双螺旋结构是基于对碱基配对规律的认识:氢键结合只发生于互补的碱基A与T、G与C之间。双螺旋分子两条链的严格互补性,是指一条链的核苷酸顺序,无例外地取决于另一条链。每一条DNA链都能作为模板,以合成一条准确地限定核苷酸顺序的新链,也是根据碱基...
分类:其他好文   时间:2015-05-18 11:02:26    阅读次数:222
开放阅读框架(ORF)
开放阅读框架(ORF)标签:开放阅读框OpenreadingframeORF顶[96]分享到发表评论(0)编辑词条开放阅读框-开放阅读框概述 开放阅读框(英语:Openreadingframe;缩写:ORF;其他译名:开放阅读框架、开放式阅读框架,开放读架等)是生物个体的基因组中,可能是蛋白质编码....
分类:其他好文   时间:2015-04-17 21:44:44    阅读次数:658
DISCOVAR de novo
海宝建议用这个拼接软件http://www.broadinstitute.org/software/discovar/blog/?page_id=98DISCOVAR – variant caller 适合于call variant 和拼接小基因组DISCOVARde novo 适合拼接大基因组下载...
分类:其他好文   时间:2015-04-05 00:57:31    阅读次数:397
基因组拼接中常见的名词解释
Read:高通量测序平台产生的序列就称为reads。Contig:拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重叠群)。Scaffold:基因组de novo测序, 通过reads拼接获得Contigs后,往往还需要构建454 Paired-end库或Illumin...
分类:其他好文   时间:2015-04-02 22:20:31    阅读次数:184
同源基因查找软件OrthoMCL的使用
OrthoMCL (http://orthomcl.org/orthomcl/)主要用来找直系同源基因以及旁系同源基因。它主要在比较完整的基因组之间找直系同源基因。OrthoMCL的使用主要13步,可以参考doc/OrthoMCLEngine/Main/UserGuide.txt。为了方便运行OrthoMCL,可以建立一个工作目录“my_orthomcl_dir”。 1>配置OrthoMCL程序...
分类:其他好文   时间:2015-02-14 22:39:23    阅读次数:966
CRISPR/Cas基因编辑技术最新研究进展
CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种后天免疫系统,其以消灭外来的质体或者噬菌体并在自身基因组中留下外来基因片段作为“记忆”。CRISPR/Cas 系统全名为常间回文重复序列丛集/常间回文重复序列丛集关联蛋白系统(clustered regularly intersp...
分类:其他好文   时间:2015-02-11 23:12:30    阅读次数:354
揭秘大数据买卖在中国
全球各个行业的数据存储量,每年都在以59%的速度暴增。面对数据交易平台这一新兴事物的兴起,在相关个人隐私和国家安全法律法规欠缺的前提下,大数据如何买卖?交易机制是什么?交易的主体是谁?存在哪些机遇和挑战? 著名基因组专家汪建说,将一个人从怀孕第一周开始,一直到生下来的整个过程全部用基因大数据模拟记....
分类:其他好文   时间:2015-01-27 12:45:07    阅读次数:215
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