CGC，简单理解癌症基因调查。最早由sanger研究所发表于《Nature Reviews Cancers》,doi:10.1038/nrc1299 文章Summary: 第四条很有意思，已知癌症基因最常见的突变类型是由于染色体易位产生嵌合基因或者将一个基因的调控元件贴到其他基因上。也就是说，结构变 ...
分类：
其他好文 时间：
2019-08-29 11:09:50
阅读次数：
93
参考文献： [1] Cheng R , Gen M , Tsujimura Y . A tutorial survey of job-shop scheduling problems using genetic algorithms—I. representation[J]. Computers a ...
分类：
编程语言 时间：
2019-07-21 13:44:40
阅读次数：
187
5.6基于外显子的保守性鉴定真核生物编码蛋白质的基因（CDS） 鉴定功能性基因的流程是：1.连锁分析找到该基因的染色体的特定区域；2.在这段序列中选择一条短序列，寻找满足两个条件的基因（条件一：因为功能性基因是可以编码出蛋白质的基因，所以它必须有可读框；条件二：因为功能性基因是保守的，所以它必须是种 ...
分类：
其他好文 时间：
2019-06-22 15:43:36
阅读次数：
149
提取fasta文件genome_test.fa中第14号染色体的序列，其内容如下： 用python以及命令行参数实现 新建.py文件“”GetSeqFromChrID.py”， python脚本如下： 命令行参数输入如下：红色字体是输入部分 结果如下： ...
分类：
编程语言 时间：
2019-05-15 09:37:43
阅读次数：
586
读取fasta文件genome_test.fa，并计算染色体总长，同时输出最长染色体编号、序列以及长度 fasta文件genom_test.fa的内容如下： >chr1ATATATATAT>chr2ATATATATATCGCGCGCGCG>chr3ATATATATATCGCGCGCGCGATATAT ...
分类：
编程语言 时间：
2019-04-29 18:49:25
阅读次数：
955
# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = [10,20,30,40,50] # 求和 # 方法一：通过循环 total_len = 0 #定义total_len的初始长度 for len in chr_len: # 从列表chr_len中每次取一个值交给len total_le ...
分类：
编程语言 时间：
2019-04-28 15:56:11
阅读次数：
142
# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr1_seq = 'ATATATATAT' chr2_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCG' chr3_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT' chr4_seq = 'ATATATATATCGCG ...
分类：
编程语言 时间：
2019-04-28 15:25:38
阅读次数：
148
# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = {'chr1':10,'chr2':20,'chr3':30,'chr4':40,'chr5':15} # 求和 total_len = sum(chr_len.values()) # 求最长染色体编号 max_chr ='' max_ ...
分类：
编程语言 时间：
2019-04-28 15:23:28
阅读次数：
140
柳叶刀发表的文献解读：Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study 背景介绍 随着超声波在产科护理中的应用，胎儿结构异常的鉴别已成为例行公事。当发现 ...
分类：
其他好文 时间：
2019-02-06 21:04:26
阅读次数：
227
