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搜索关键字:染色体    ( 90个结果
遗传算法解决0-1背包问题
1 import numpy 2 import matplotlib.pyplot as plt 3 4 5 data = numpy.array([[77, 92], 6 [22, 22], 7 [29, 87], 8 [50, 46], 9 [99, 90]]) 10 11 12 class G ...
分类:编程语言   时间:2018-04-13 20:40:26    阅读次数:198
Matlab遗传算法优化问题求解的演示样例代码
代码例如以下: function m_main() clear clc Max_gen = 100;% 执行代数 pop_size = 100;%种群大小 chromsome = 10;%染色体的长度 pc = 0.9;%交叉概率 pm = 0.25;%变异概率 gen = 0;%统计代数 %初始化 ...
分类:编程语言   时间:2018-03-05 11:25:30    阅读次数:209
神经网络与遗传算法
神经网络是用来处理 非线性关系的,输入和输出之间的关系可以确定(存在非线性关系),可以利用神经网络的自我学习(需要训练数据集 用明确的输入和输出),训练后权值确定,就可以测试新的输入了。 遗传算法是用来解决最值问题的,生物进化、优胜略汰。更灵活没有限制,唯一的难处就是 编码染色体 和评价函数的选择。 ...
分类:编程语言   时间:2018-03-04 18:10:32    阅读次数:156
ucsc genome brower的用法和说明(一)
官网说明书:http://genome.ucsc.edu/goldenpath/help/hgTracksHelp.html 1.genome brower的作用 a,展示任何尺度的基因组片段。比如,想看某条染色体的某个区域的序列。 b,展示某些位置的annotation tracks。比如,你得到 ...
分类:其他好文   时间:2017-10-27 15:57:50    阅读次数:193
vba遗传算法
1 Option Explicit 2 3 '遗传算法参数 4 Dim GeneLength As Integer '染色体长度 5 Dim swarmNum As Integer '种群规模 6 Dim Pc As Double '杂交概率 7 Dim Pm As Double '突变概率 8 D ...
分类:编程语言   时间:2017-09-20 23:14:36    阅读次数:206
共线性synteny
植物基因组在染色体大小和数目上差异很大,在一些十字花科植物如拟南芥,只不过100 Mb差异,而在百合属中竟高达100000 Mb。但是基因的数目和类型并没有这样明显的差别。不同植物基因组之间大小差异是由于基因组内存在重复DNA的缘故(多倍性这是一种原因)。在植物进化过 程中,基因组大小变化是一种相对 ...
分类:其他好文   时间:2017-08-31 23:07:50    阅读次数:183
人的基因组
大小3.0G 30个bp(碱基对) ; 60亿nt (碱基) 从1990-2003年,历时13年,耗费30亿美元,1bp/1$; 我国承担:人类3号染色体短臂上.由于这一区域约占人类基因组的1%,因此简称为“1%项目”.我国科学家对被国际同行称为“北京区域”的这一部分进行了详细分析,共测定3.84亿 ...
分类:其他好文   时间:2017-08-06 18:11:45    阅读次数:154
读取gff/gtf文件的内容
题目和内容参考jimmy大神的http://www.biotrainee.com/thread-626-1-1.html gff文件来自gencode的genode.v26.annotation.gft.gz 目的:熟悉gff文件内容,练习提取数据操作 1.统计每一条染色体的基因数目: 2.统计每一 ...
分类:其他好文   时间:2017-07-26 23:46:52    阅读次数:293
23andme、gsa、wegene各染色体位点统计
shell还没入门,确切的说是还没学,用python3写了个小脚本统计23andme、gsa、wegene各染色体位点.代码如下:23andme: gsa的同上,稍做一两处调整。wegene的没有源数据,找的生信菜鸟团jimmy的shell # 结果分析 从图中可以看出,毕竟23andme是最早做的 ...
分类:其他好文   时间:2017-07-20 15:24:59    阅读次数:184
基因突变基本知识
赛福基因公开课今天正式开讲。第一课我们来对基因检测进行基本的介绍。 今天我主要从以下两个方面介绍一下基因检测的基础知识,一是基因,包括细胞、染色体、DNA、基因的简单介绍。另一是基因突变,包括基因突变的概念介绍,基因突变的来源以及基因突变的类型及对蛋白的影响等。 在精准医疗中基因检测这个领域,有一个 ...
分类:其他好文   时间:2017-05-22 21:28:54    阅读次数:245
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