索引 1.统计fasta、fa和fastq文件的长度,统计fastq的reads个数,单个reads长度,reads总长度;统计fasta文件中contig的个数,列出名称,单条的长度,以及总长度。 1.统计fasta、fa和fastq文件的长度,统计fastq的reads个数,单个reads长度,... ...
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2016-08-11 17:49:24
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Tel-Aviv大学深度学习实验室的Ofir同学写了一篇如何入门深度学习的文章,顺手翻译一下,造福生物信息狗。 人工神经网络最近在很多领域(例如面部识别,物体发现和围棋)都取得了突破,深度学习变得炙手可热。如果你对深度学习感兴趣的话,这篇文章是个不错的起点。 如果你学过线性代数,微积分,概率论和编程 ...
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2016-07-09 19:31:39
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这是我自己编程技能提升途径的总结,主要有以下三点:业务驱动,修炼技能合作需求,扩展技能个人兴趣,不为金钱,只为快乐和创造最近刚入职两个月,同样从事的是生物信息分析,之所以从事当前这个行业,原因在于读大学时几乎大多数的专家,高级知识分子都提出“21世纪是生命科..
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2016-06-16 11:47:46
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字符串匹配一直是计算机领域热门的研究问题之一,多种算法层出不穷。字符串匹配算法有着很强的实用价值,应用于信息搜索,拼写检查,生物信息学等多个领域。
今天介绍几种比较有名的算法:
1. BF
2. BM
3. Sunday
4. KMP—,BF算法
BF(Brute Force)算法又称为暴力匹配算法,是普通模式匹配算法。其算法思想很简单,从主串S的第pos个字符开...
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2016-05-07 07:21:50
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写好英语科技论文的诀窍:主动迎合读者期望,预先回答专家可能质疑 周 耀 旗印地安那大学信息学院印地安那大学医学院计算生物学和生物信息中心 以此文献给母校中国科技大学五十周年校庆 前 言 我的第一篇英语科技论文写作是把在科大的学士毕业论文翻译成英文。当我一九九零年从纽约州立大学博士毕业时,发表了20多 ...
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2016-03-30 14:58:36
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生物信息学专业类: 1.《python语言》 2.每月2篇SCI文章 经济类: 1.《国富论》(上、下) 2.《美国货币史》 心理类: 1.《少有人走的路Ⅱ:与心灵对话》 2.《少有人走的路Ⅲ:心灵地图》 市场营销类: 2本 产品经理类: 2本 人物传记类: 2本 其他: 《乔布斯演讲》 其他书10
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2016-02-18 13:38:53
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MATLAB 矩阵实验室 7.0.1 Simulink 仿真 6.1 Aerospace Blockset 太空模块 1.6.1 Bioinformatics Toolbox 生物信息工具箱 1.1.1 CDMA Reference Blockset 码分多址参数模块 1.1 Communicati
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2016-02-03 08:15:33
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python是一款应用非常广泛的脚本程序语言,谷歌公司的网页就是用python编写。python在生物信息、统计、网页制作、计算等多个领域都体现出了强大的功能。python和其他脚本语言如java、R、Perl 一样,都可以直接在命令行里运行脚本程序。本文给大家介绍一下如何在命令行里运行python...
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2015-12-20 20:48:26
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随着互联网的普及和技术的发展,大数据和云计算已经渗透在人们的生活的各个方面,在金融,零售,能源,交通等领域已经得到广泛应用。而对于生物信息来说,生物的DNA,基因序列,生物芯片等无时无刻不产生新的数据;比如说,DNA测序每年能够产生大约150亿兆(PB级)的数据,如果将这些数据存储在DVD中,那么刻...
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2015-12-04 14:39:30
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隐马尔可夫模型(Hidden Markov Model,HMM) 最初由 L. E. Baum 和其它一些学者发表在一系列的统计学论文中,随后在语言识别,自然语言处理以及生物信息等领域体现了很大的价值。平时,经常能接触到涉及HMM的相关文章,一直没有仔细研究过,都是蜻蜓点水,因此,想花一点时间梳理下...
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2015-11-19 16:37:04
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