1.信息与数据的区别是什么？ 信息是具有关联性和目的性的结构化、组织化的数据。信息是对客观世界各种事物的特征的反映。比如气温变化属于自然信息，遗传密码属于生物信息，企业报表属于管理信息，等等。信息是可以通信的。信息是构成事物联系的基础。 信息的概念不同于数据。 数据是记录客观事物的、可鉴别的符号。这 ...
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2017-09-05 12:30:45
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转载：http://blog.sina.com.cn/s/blog_c5a35e780102wtxl.html 生物信息很多软件都是用java写的，所以需要在linux上配置java运行环境。平台上的java 是1.7x的版本，但是一些生物信息软件（比如picard，trimmomatic,GATK ...
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2017-09-03 17:50:52
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转载：http://boyun.sh.cn/bio/?p=1711 这里对多重序列比对格式(Multiple sequence alignment – MSA)进行总结。在做系统演化分析、序列功能分析、基因预测等，都需要涉及到多重序列比对。特别是当需要用不同软件对多重比对序列进行批量操作时，会遇到各 ...
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2017-08-31 23:11:31
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挑战：寻找新的处理海量数据和复杂性的方法。 生信：说了什么： 研究对象： 以核酸、蛋白质等生物大分子数据库 研究手段方法：数学、信息学、计算机科学 研究工具： 计算机硬件、软件、计算机网络 研究目的： 对浩如烟海的原始数据进行获取、加工、存储、分配、分析、管理、注释解释，使之成为具有明确生物意义的生 ...
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2017-08-31 14:34:08
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1、 Bioconda是一个自动化管理生物信息软件的工具，就像APPstore、360软件管家一样。 Bioconda的优点是安装简单，各个软件依赖的环境一同打包且相互隔离，非常适合在服务器中建立自己的生物信息分析环境 1.下载和安装miniconda bioconda的使用首先需要安装minico ...
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2017-08-23 00:45:08
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文章转载于 Original 2017-06-08 Jolvii 生信百科 由于生物信息的大部分工作都是在没有 root 权限的集群上进行的，本期我主要介绍一下非 root 用户怎么安装常用的软件。工欲善其事，必先利其器！ 准备工作 1 首先我们建一个文件夹，用来存储我们自己编译的程序 ($HOME ...
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2017-07-16 00:01:10
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第一章糖（Carbohydrate）一、糖类的存在和来源糖类是地球上最丰富的有机化合物，具有最广谱化学结构和生物学功能的生物分子，植物体85%-90%的干重是糖类（植物体含糖类最多，比如棉纤维的糖类含量几乎可以达到干重的全部），地球上的生物量（biomass）50%以上是由葡萄糖的聚合..
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2017-07-07 11:43:08
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基于快速搜索与寻找密度峰值的聚类（Alex Rodriguez and Alessandro Laio） 摘要：聚类分析目的是基于元素之间的相似度对其进行分类，应用范围从天文学到生物信息学、文献计量学到模式识别。我们提出一种方法，思想基于簇中心具有比其邻居更大密度的特点以及与更大密度点之间有一个相对 ...
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2017-06-15 23:34:07
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生物信息资源更新越来越快,使用可视化的方法来分析DNA序列已成为生物信息学的一个研究热点,用图形表示DNA序列的方法也越来越成熟。2011年，著名杂志《Science》发表一篇引起轰动的文章:《Presenting the Human Genome:Now is 3D!》,这篇文章全然给我们描写叙述 ...
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2017-04-29 17:39:45
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最开始学的就是C和C++，但只是学过，根本就不知道怎么使用。 后来接触了Python和Perl才知道怎么将编程应用于实际需求当中，读取文件，存放到数据结构，处理，输出。 但脚本语言有其固有的缺点，不能用于高速计算。 生物信息的基础是大数据（G~T级别），我们不仅要优化算法，还得选择接近底层的语言，那... ...
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2017-04-18 00:48:14
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