提取细菌基因组ORF思路： 1.通过FNA文件得到细菌基因组序列 2.分正负链和三个相位共6种情况统计ORF 3.写入文件 转载请保留出处！ 统计细菌基因组ORF 贴上Python代码（版本：3.6） NCBI可以找ORF，很方便。码一下：ORFfinder ...
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2017-12-14 17:00:30
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P3670 [USACO17OPEN]Bovine Genomics S奶牛基因组（银） P3670 [USACO17OPEN]Bovine Genomics S奶牛基因组（银） P3670 [USACO17OPEN]Bovine Genomics S奶牛基因组（银） 题目描述 Farmer Joh ...
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2017-12-11 23:03:08
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如果你曾经看过《犯罪现场》这样的罪案剧，你可能会想起一个场景：法医通过电脑对数千个DNA片段进行搜索，从而匹配出犯罪现场和犯罪嫌疑人。虽然这个过程在现实生活并不像电视剧那样，但是主要思路是一样的。遗传学本质上是一门比较科学。无论你是想确认一名嫌疑犯、一种基因疾病还是一名失散已久的亲属，都需要将一个基 ...
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2017-12-11 00:39:09
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本文关于如何在 的 里下载需要的基因组数据。 例如：我想从NCBI上下载 __ Escherichia coli ATCC 25922__。 已知信息 原文提供的信息是： This Whole Genome Shotgun project has been deposited at DDBJ/EMB ...
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2017-11-24 15:06:05
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转自声明的奥秘 www.lifeomics.com DNA甲基化与肿瘤发生： DNA甲基化水平和模式的改变是肿瘤发生的一个重要因素。这些变化包括CpG岛局部的高甲基化和基因组DNA低甲基化状态。如图1左所示，在正常细胞中，位于抑癌基因启动子区域的CpG岛处于低水平或未甲基化状态，此时抑癌基因处于正常 ...
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2017-11-10 20:08:34
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最近从公共数据库下载了一堆bam文件和reference 基因组文件，重新分析外显子流程时，跑出了“Exception in thread "main" picard.PicardException: New reference sequence does not contain a matchin ...
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2017-10-28 15:31:26
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官网说明书：http://genome.ucsc.edu/goldenpath/help/hgTracksHelp.html 1.genome brower的作用 a,展示任何尺度的基因组片段。比如，想看某条染色体的某个区域的序列。 b,展示某些位置的annotation tracks。比如，你得到 ...
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2017-10-27 15:57:50
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1.>c-Bioportal: www.cbioportal.org 整合和简化了包括TCGA，ICGC以及GEO等多个癌症基因组数据库的内容，提供友好可视化的界面，可供下载。 主要展示基因的somatic 突变谱，拷贝数变化，mRNA&miRNA表达量变化，DNA甲基化以及蛋白质表达的情况，并结合 ...
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2017-10-17 15:16:19
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Description 小强和阿米巴是好朋友。 阿米巴告诉小强，变形虫（又叫阿米巴虫）和绝大多数生物一样，也是有 DNA 的。并且，变形虫可以通过分裂的方式进行无性繁殖。 我们把一个变形虫的基因组抽象成一个大小为 L 的基因集合。每个基因都是一个 4 位长的字符串（字符包括大小写字母、数字、符号“~ ...
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2017-09-29 21:22:29
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生物纳米分子的“原始数据到完成装配和组装分析”管线与基于序列的基因组FASTA映射 您完成本实验以及示例数据集所需的所有脚本将按照以下说明复制到计算机。您应该按照以下说明，将米色代码块中的文本键入或粘贴到终端中。如果你不习惯命令行，用真实数据练习是最好的学习方式之一。 注意：此管道旨在运行在具有57 ...
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2017-09-23 18:55:25
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