遗传算法基本原理 遗传算法是从代表问题可能潜在解集的一个种群开始的，而一个种群则由经过基因编码的一定数量的个体组成。每个个体实际上是染色体带有特征的实体。作为多个基因的集合，单个染色体是遗传物质的主要载体，其在种群中的命运由其基因组合决定。初始种群产生以后按照优胜劣汰、适者生存的原理，逐代演化产生出 ...
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2018-10-21 12:08:08
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4.NGS中的reads mapping 顾名思义，就是将测序的得到的DNA定位在基因组上。 因为二代测序的得到的序列是较短的，reads mapping很好地解决了这个问题。 本质上reads mapping是一个双序列比对问题，但和之前讲的NW和SW的不一样，后者适用于两者长度相差不大的。 现在 ...
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2018-10-20 11:44:13
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三代组装小基因组研究综述 三代测序 组装 三代组装各种原理和方法都有。 近日illumina发布了新的测序仪NovaSeq系列，这个测序是相当的便宜，这个可能对于打开100美元人类基因组时代的大门有巨大的帮助。不过本篇文章小编不讲NovaSeq，感兴趣的自行百度就可以了。 小编目前主要是三代动植物基 ...
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2018-10-19 23:44:42
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全基因组重测序基础及高级分析知识汇总 oddxix 已关注 2018.09.20 17:04 字数 11355 阅读 212评论 0喜欢 6 oddxix 已关注 2018.09.20 17:04 字数 11355 阅读 212评论 0喜欢 6 2018.09.20 17:04 字数 11355 阅 ...
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2018-10-19 20:18:10
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什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 随着ome为词尾的各种组学的出现，转录组学已经成为了人们了解生物信息的一个重要组成部分。人们使用了许多办法来掌握转录组的情况，主要分为两类，一类是基于杂交，一类是基于下一代测序技术(Next Generat ...
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2018-10-18 23:55:36
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为什么二代测序的原始数据中会出现Read重复现象？ 要搞清楚这个read重复（duplicate）的问题，我想我们需要从NGS数据的产出过程说起，具体来说如下： 基因组DNA提取； DNA随机打断，最常用的是超声打断； 对被打断的DNA片段进行末端修复（通常是3'加A），然后在两端加接头，选择特定长 ...
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2018-10-18 22:09:48
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第三章 RNA测序 RNA测序（RNA Sequencing，简称RNA-Seq，也被称为全转录物组鸟枪法测序Whole Transcriptome Shotgun Sequencing，简称WTSS），是基于二代测序技术研究转录组学的方法，可以快速获取给定时刻的一个基因组中RNA的种类和数量。 R ...
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2018-10-16 01:42:23
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生信研究内容 目前生物信息学 的研究情况来看，国际上公认的生物信息学的研究内容，大致包括以下几个方面： 1. 生物信息的收集、存储、管理与提供。包括建立国际基本生物信息库和生物 信息传输的国际联网系统；建立生物信息数据质量的评估与检测系统；生物信息的在线服务；生物信息可视化和专家系统。 2. 基因组 ...
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2018-10-15 23:11:50
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问题描述 输入格式 输出格式 样例输入 样例输出 数据范围 题解 把初始串复制一遍，接在后面，然后求前缀和sum 则Ak,Ak+1,……,An-1,A0,A1……,Ak-1即为Ak,Ak+1,……,An-1,An,An+1……,An+k-1 任意的前i项和为sum[i]-sum[k-1] 满足对于任 ...
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2018-10-04 21:37:35
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在真核生物中，大多数的基因可以编码多个蛋白质，这是因为基因经过可变剪接，可产生多个转录异构体，从而大大增加基因组的蛋白编码潜力。来自同一个基因的可变剪接异构体可能有着明显不同、甚至拮抗的作用。为了研究基因表达，研究人员利用新一代测序方法研究了生物体各个基因的片段，这种方法通常称为RNA测序（RNA ...
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2018-09-06 16:17:00
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