解读生命密码的基本手段 ——DNA测序技术的前世今生 任鲁风 于军 （中国科学院基因组科学及信息重点实验室，北京基因组研究所） DNA（脱氧核糖核酸）和RNA（核糖核酸）是生命体的两种最基本组成物质，其序列的组成和变化造就了形形色色的生命世界。这两种承担了生命体遗传信息载体功能的物质，一方面在生命的 ...
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2019-10-08 22:25:30
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生命组学： 比较真核生物有关呼吸链的gene是比较核外编码基因，因为与呼吸有关的功能在线粒体上，线粒体位于核外。想要查看两种基因是否具有相互作用，可以对不同物种的编码ATP6 和ATP8的直系同源基因构建共进化树；可以绘制热图观察其区块化现象；可以计算相关系数；可以绘制箱图，进行类别之间相互比较，可 ...
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2019-10-01 22:32:02
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一般来说，基因融合是指基因组层面的融合。但转录组层面也可能发生融合，主要是由于两个不同基因转录产生的RNA，由于某种原因融合在了一起，形成新的融合RNA，该RNA可能编码蛋白，也可能为非编码。而基因组层面产生的融合基因，根据融合的情况，可能表达，也可能不表达（如破坏了启动子区域或其他原因）。基因融合... ...
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2019-10-01 16:01:02
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机器的反叛-机器的智能会超越人类吗？ 学号：4519205012 姓名：姬英杰 人工智能的发展趋势问题从20世纪80年代在国内外就进行了非常激烈的辩论。既有认为人工智能只能作为人的工具的延长而不可能取代人的大脑的工具论,他们认为:人工智能诞生的初衷是作为人类工具的延长,其作用从其诞生的那一天就已经定 ...
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2019-09-29 23:54:52
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因为结构变异是造成物种表型差异的一个重要原因，且与各类疾病，特别是癌症的发生、发展紧密相关，因此研究结构变异非常重要。结构变异通常是指长度大于1Kb的基因组序列变异，包括多种不同的类型：插入（insertion）、缺失（deletion）、反转（inversion）、异位（translocation... ...
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2019-09-24 12:06:49
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肿瘤基因组图谱 (The Cancer Genome Atlas，TCGA) 计划是由美国国家癌症研究院（National Cancer Institute，NCI）和美国国家人类基因组研究所（National Human Genome Research Institute，NHGRI）于2006年... ...
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2019-09-21 21:37:55
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单核苷酸多态性，英文single nucleotide polymorphism，缩写为SNP，读音为Snip。SNP主要是指在基因组水平上引起的单个碱基的变异，其在群体中的发生频率不小于1%，包括单碱基的转换、颠换以及单碱基的插入和缺失等。突变（mutation）和多态性（polymorphism... ...
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2019-09-21 10:57:55
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生命组学： 泛基因组学：用于描述一个物种基因组，据细菌基因组动力学，因为细菌的基因漂移使得各个细菌之间的基因组差异很大，（单个细菌之间的基因组差异是以基因为单位的gain&loss，而人类基因组，在个体角度两个人之间基因组差异不到1%，主要是SNP，所以CRISPR/Cas9也由细菌得来），所以转而 ...
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2019-09-12 09:41:28
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本文主要是对没有GO term库的植物进行注释。 1、选用AgriGo 进行注释，在agriGO中点击species后，查看与你目标物种相近的物种作为库 2、比如我以甜菜为例 为了找到和GO term对应的ID，先找到PLAZA，进入网站https://bioinformatics.psb.ugen ...
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2019-09-09 15:04:26
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使用DBG2OLC软件利用二代和三代数据混合的基因组组装： 使用DBG2OLC找Contigs序列和Pacbio reads的Overlap并进行Layout DBG2OLC通过比较contigs和Pacbio reads之间的overlap，将contigs序列定位到Pacbio reads上，将 ...
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2019-09-06 15:56:17
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